| เวอร์ชัน | 1.5 |
|---|---|
| สำนักพิมพ์ | Bioinformatics Solutions |
| วันที่วางจำหน่าย | 18 พ.ค. 2010 |
| วันที่เพิ่ม | 14 ก.ค. 2010 |
| ข้อกำหนดระบบปฏิบัติการ | Windows XP/Vista/7 |
| ข้อกำหนด | None |
| ดาวน์โหลดทั้งหมด | 1,034 |
| ดาวน์โหลดต่อสัปดาห์ | 21 |
| ราคา | Free |
คำอธิบาย
ZOOM Lite เป็นซอฟต์แวร์การทำแผนที่และการสร้างภาพข้อมูลลำดับถัดไป ผู้ใช้ป้อนข้อมูลจีโนมอ้างอิงและไฟล์อ่านสั้นของ Illumina/Solexa หรือพื้นที่สี AB SOLiD อ่านไฟล์ในรูปแบบต่างๆเช่น * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta เป็นต้น ZOOM แสดงผลลัพธ์การทำแผนที่ของระยะสั้นเหล่านี้ อ่านลำดับการอ้างอิง ZOOM Lite มีเคอร์เนลการแมปที่รวดเร็วและแม่นยำตามทฤษฎีเมล็ดพันธุ์ที่มีระยะห่างหลายอันที่ออกแบบใหม่ สามารถจัดการการอ่านทั้ง single-end และ pair-end ที่มีความยาวต่างๆตั้งแต่ 15bp ถึง 240bp อนุญาตให้มีจำนวนที่ไม่ตรงกันและการแทรก/ลบความยาวต่างๆระหว่างการอ่านและขอบเขตเป้าหมายในลำดับการอ้างอิง ผลลัพธ์ที่แมปแบบไม่ซ้ำกันหรือผลลัพธ์ที่ดีที่สุด (N บนสุด) สำหรับการอ่านแต่ละครั้งจะถูกรายงานตามความไม่ตรงกันน้อยที่สุดและความยาวอินเดล คะแนนคุณภาพถูกใช้เพื่อเพิ่มความแม่นยำในการทำแผนที่ จากเคอร์เนลการแมป ZOOM Lite ช่วยให้ผู้ใช้โหลดข้อมูลการอ่านในเครื่องและข้อมูลลำดับการอ้างอิงเลือกพารามิเตอร์ที่เหมาะสมประมวลผลข้อมูลปริมาณมากพร้อมกันระหว่างซีพียูสูงสุดสี่ตัวตรวจสอบงานที่กำลังทำงานเก็บผลการทำแผนที่ดูกราฟของ ผลลัพธ์การแมปและผลลัพธ์การแมปผลลัพธ์ในรูปแบบไฟล์ * .BED หรือ * .GFF สำหรับการสำรวจเพิ่มเติมด้วยข้อมูลการติดตามเบราว์เซอร์ UCSC คุณสามารถดูผลการแมปได้ในขนาดที่ต้องการตั้งแต่กราฟความลึกของการอ่านบนโครโมโซมทั้งหมดไปจนถึงการจัดเรียงลำดับโดยละเอียดระหว่างการอ่านและลำดับการอ้างอิง ผู้ใช้นำทางไปยังพื้นที่ที่สนใจได้อย่างง่ายดายเพียงแค่คลิกแล้วลากหรือเลื่อน ZOOM Lite เป็นอนุพันธ์ของซอฟต์แวร์ ZOOM Studio
