| เวอร์ชัน | 4.5 |
|---|---|
| สำนักพิมพ์ | Bioinformatics Solutions |
| วันที่วางจำหน่าย | 10 พ.ค. 2010 |
| วันที่เพิ่ม | 16 ก.ค. 2010 |
| ข้อกำหนดระบบปฏิบัติการ | Windows XP/Vista/7 |
| ข้อกำหนด | None |
| ดาวน์โหลดทั้งหมด | 9,464 |
| ดาวน์โหลดต่อสัปดาห์ | 9 |
| ราคา | Free |
คำอธิบาย
RAPTOR เป็นซอฟต์แวร์นวัตกรรมที่ออกแบบมาเพื่อการทำนายโครงสร้างโปรตีนที่แม่นยำ มันรวมเครื่องมือวิเคราะห์ขั้นสูงไว้ในโซลูชันซอฟต์แวร์แบบบูรณาการเดียวและมีวิธีการเธรดที่แตกต่างกันสามวิธี แนวทางการเพิ่มประสิทธิภาพการเขียนโปรแกรมจำนวนเต็มเฉพาะของ RAPTOR มีประสิทธิภาพสูงสุดสำหรับการค้นหาเทมเพลตโครงสร้างของเป้าหมายที่มีลำดับความคล้ายคลึงกันต่ำและสามารถสร้างโมเดลคุณภาพสูงได้ อินเทอร์เฟซที่ใช้งานง่ายและค่า E ที่เข้าใจง่ายเหมาะอย่างยิ่งสำหรับผู้เริ่มต้นและผู้เชี่ยวชาญ เหนือสิ่งอื่นใดการแสดงผลที่ใช้งานง่ายช่วยให้ผู้ใช้เข้าใจผลลัพธ์ได้ในพริบตา เมื่อพิจารณาถึงลำดับโปรตีนเป้าหมายหากมีโปรตีนที่คล้ายคลึงกันซึ่งมีโครงสร้าง 3 มิติที่รู้จักกันสามารถพบได้โดยใช้เครื่องมือค้นหาลำดับเช่น PSI-BLAST ซึ่งมีให้ใน RAPTOR จากนั้นโครงสร้างของเป้าหมายจะถูกสร้างขึ้นจากโครงสร้างที่รู้จัก อย่างไรก็ตามเมื่อความคล้ายคลึงกันของลำดับไม่มีนัยสำคัญเช่นน้อยกว่า 25% PSI-BLAST จะไม่สามารถสร้างการตีที่มั่นใจได้ ซึ่งแตกต่างจาก PSI-BLAST ซึ่งเพียงแค่ค้นหาลำดับการทำเกลียวโปรตีนการจดจำการพับใช้ประโยชน์จากทั้งข้อมูล homology และโครงสร้าง มันจะสแกนลำดับโปรตีนที่มีโครงสร้างที่ไม่รู้จักเทียบกับฐานข้อมูลของโครงสร้างที่รู้จัก ด้วยการใช้ฟังก์ชันการให้คะแนนและทำการวิเคราะห์ความเข้ากันได้ระหว่างโครงสร้างสามมิติและลำดับโปรตีนเชิงเส้นแม่แบบโครงสร้างที่ดีที่สุดจะถูกระบุเพื่อสร้างโครงสร้างของลำดับ ด้วยเหตุนี้การทำเกลียวโปรตีนจึงให้การทำนายที่เหนือกว่าการสร้างแบบจำลองโฮโมโลยีเมื่อมีความคล้ายคลึงกันของลำดับขอบ
