FlexS

คำอธิบาย

FlexS ทำนายรูปแบบและการวางแนวของแกนด์ตัวใดตัวหนึ่งที่สัมพันธ์กับแกนด์อีกตัวหนึ่ง ใน FlexS ลิแกนด์อ้างอิงจะถือว่าเข้มงวด ดังนั้น จึงควรกำหนดในรูปแบบที่คล้ายกับสถานะที่ถูกผูกไว้ อัลกอริธึมการซ้อนภาพใน FlexS ต้องการการแทรกแซงด้วยตนเองเพียงเล็กน้อยเท่านั้น คุณสามารถรวมความรู้นี้เข้ากับการคำนวณด้วย FlexS ได้โดยทำตามขั้นตอนเดียวด้วยตนเอง ดังนั้น FlexS ได้รับการออกแบบมาสำหรับการทำงานแบบโต้ตอบบนคู่ลิแกนด์ เช่นเดียวกับการคัดกรองเสมือนแบบลิแกนด์ การใช้งานหลักสองประการของ FlexS คือการวางตำแหน่งซุปเปอร์ลิแกนด์ (เช่น สำหรับ CoMFA/QSAR) และการคัดกรองเสมือน หากคุณมีโปรตีนและโมเลกุลขนาดเล็กที่จับกับมัน (เรียกว่าลิแกนด์อ้างอิง) แต่ไม่มีโครงสร้างของโปรตีน คุณสามารถใช้โครงสร้างอ้างอิงเป็นลายนิ้วมือเชิงลบของไซต์แอคทีฟได้ FlexS กำหนดความคล้ายคลึงกันระหว่างการทดสอบและโครงสร้างอ้างอิงโดยการจัดตำแหน่ง ในการคัดกรองเสมือน คุณมีลิแกนด์อ้างอิงและชุดของสารประกอบ และคุณมีความสนใจในการจัดลำดับความสำคัญของสารประกอบสำหรับการทดสอบทดลอง